Учреждение «Республиканский центр олимпийской подготовки по воднолыжному спорту» является правопреемником Республиканской специализированной детско-юношеской школы олимпийского резерва по воднолыжному спорту. Специализированная детско-юношеская школа олимпийского резерва по воднолыжному спорту создана приказом Белорусского республиканского совета ВДСО «Трудовые резервы» с правом юридического лица (№ 692 от 22 июня 1989 года). Приказом Министерства образования Республики Беларусь от 16 декабря 1992 года № 2766 на базе Республиканской физкультурно-спортивной организации «Трудовые резервы» был создан Центр физического воспитания и спорта учащихся и студентов Министерства образования Республики Беларусь. Решением Центра физического воспитания и спорта учащихся и студентов Министерства образования Республики Беларусь от 12 ноября 1993 года утверждено положение, в соответствии с которым специализированная детско-юношеская школа олимпийского резерва по воднолыжному спорту стала именоваться Республиканской специализированной детско-юношеской школой олимпийского резерва по воднолыжному спорту. Приказом Министерства образования Республики Беларусь от 21 июня 2001 года № 321 Республиканская специализированная детско-юношеская школа олимпийского резерва по воднолыжному спорту переименована в Республиканский центр олимпийской подготовки по воднолыжному спорту.